После того как Рин и его друзья сумели победить Нечистого Короля во время его возрождения в Киото, они вернулись к привычной жизни в Академии Истинного Креста. Однако спокойствие длилось недолго, ведь Рыцари Истинного Креста начинают сталкиваться с растущим числом обращений о демонической активности. Необъяснимые и загадочные происшествия, происходящие по всему миру, вызывают всё больше беспокойства. Одновременно с этим Рин и другие Эксвайры пытаются раскрыть секрет таинственного феномена, который начинает преследовать их школу. В это время в разгаре подготовки к фестивалю Академии, когда все заняты своими делами, появляется Люцифер, Король Света и лидер Иллюминатов. Он неожиданно бросает вызов рыцарям, объявляя о начале войны с целью воскрешения могущественного Сатаны. Люцифер замышляет объединить миры Ассии и Геенны в одно целое, и для этого ему необходим Изумо, который, как оказалось, играет ключевую роль в его опасном плане.